Pato

Patricio Manque

Full Professor


PATRICIO.MANQUE@UMAYOR.CL


Obtuvo su doctorado en Microbiología e Inmunologia en la Universidad Federal de Sao Paulo, Brasil (UNIFESP). Posteriormente el realizó un Postdoctorado en la misma universidad y un segundo Postdoctorado en Genómica en la Virginia Commonwealth University, Estados Unidos. Posteriormente, regresó a Chile donde fundó, en la Universidad Mayor, el primer Centro de Genómica de Chile. En este centro, comenzó a aplicar abordajes de biología de sistemas para estudiar enfermedades neurodegenerativas



Matamala, J.M., R. Arias-Carrasco, C. Sanchez, M. Uhrig, L. Bargsted, S. Matus, V. Maracaja-Coutinho, S. Abarzua, B. van Zundert, R. Verdugo, P. Manque, and C. Hetz. 2018. Genome-wide circulating microRNA expression profiling reveals potential biomarkers for amyotrophic lateral sclerosis. Neurobiol. Aging. 64:123–138. doi:10.1016/j.neurobiolaging.2017.12.020.

Sánchez, C., J. Villacreses, N. Blanc, L. Espinoza, C. Martinez, G. Pastor, P. Manque, S.F. Undurraga, and V. Polanco. 2016. High quality RNA extraction from Maqui berry for its application in next-generation sequencing. Springerplus. 5. doi:10.1186/s40064-016-2906-x.

Sánchez, C., J. Villacreses, N. Blanc, L. Espinoza, C. Martinez, G. Pastor, P. Manque, S.F. Undurraga, and V. Polanco. 2016. High quality RNA extraction from Maqui berry for its application in next-generation sequencing. Springerplus. 5. doi:10.1186/s40064-016-2906-x.

Yañez, A.J., C. Molina, R.E. Haro, P. Sanchez, A. Isla, J. Mendoza, M. Rojas-Herrera, A. Trombert, A.X. Silva, J.G. Cárcamo, J. Figueroa, V. Polanco, P. Manque, V. Maracaja-Coutinho, and V.H. Olavarría. 2014. Draft genome sequence of virulent strain AUSTRAL-005 of Piscirickettsia salmonis, the etiological agent of piscirickettsiosis. Genome Announc. 2. doi:10.1128/genomeA.00990-14.

Yanez, A.J., C. Molina, R.E. Haro, P. Sanchez, A. Isla, J. Mendoza, M. Rojas-Herrera, A. Trombert, A.X. Silva, J.G. Carcamo, J. Figueroa, V. Polanco, P. Manque, V. Maracaja-Coutinho, and V.H. Olavarria. 2014. Draft Genome Sequence of Virulent Strain AUSTRAL-005 of Piscirickettsia salmonis, the Etiological Agent of Piscirickettsiosis. Genome Announc. 2:e00990-14-e00990-14. doi:10.1128/genomeA.00990-14.

Manque, P.A., U. Woehlbier, A.M. Lara, F. Tenjo, J.M. Alves, and G.A. Buck. 2012. Identification and characterization of a novel calcium-activated apyrase from cryptosporidium parasites and its potential role in pathogenesis. PLoS One. 7. doi:10.1371/journal.pone.0031030.

Manque, P.A., C.M. Probst, M.C.S. Pereira, R.C.P. Rampazzo, L.S. Ozaki, D.P. Pavoni, D.T.S. Neto, M.R. Carvalho, P. Xu, M.G. Serrano, J.M.P. Alves, M.N.S.L. Meirelles, S. Goldenberg, M.A. Krieger, and G.A. Buck. 2011. Erratum: Trypanosoma cruzi infection induces a global host cell response in cardiomyocytes. Infect. Immun. 79. doi:10.1128/IAI.05449-11.

Manque, P.A., C. Probst, M.C.S. Pereira, R.C.P. Rampazzo, L.S. Ozaki, D.P. Pavoni, D.T. Silva Neto, M.R. Carvalho, P. Xu, M.G. Serrano, J.M.P. Alves, M. d. N.S.L. Meirelles, S. Goldenberg, M.A. Krieger, and G.A. Buck. 2011. Trypanosoma cruzi Infection Induces a Global Host Cell Response in Cardiomyocytes. Infect. Immun. 79:1855–1862. doi:10.1128/IAI.00643-10.

Manque, P.A., F. Tenjo, U. Woehlbier, A.M. Lara, M.G. Serrano, P. Xu, J.M. Alves, R.B. Smeltz, D.H. Conrad, and G.A. Buck. 2011. Identification and immunological characterization of three potential vaccinogens against Cryptosporidium species. Clin. Vaccine Immunol. 18:1796–1802. doi:10.1128/CVI.05197-11.

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Graça-de Souza, V.K., V. Monteiro-Góes, P. Manque, T.A.C.B. Souza, P.R.C. Corrêa, G.A. Buck, A.R. Ávila, L.M. Yamauchi, P. Pinge-Filho, S. Goldenberg, M.A. Krieger, and S.F. Yamada-Ogatta. 2010. Sera of chagasic patients react with antigens from the tomato parasite Phytomonas serpens. Biol. Res. 43:233–241. doi:10.4067/S0716-97602010000200011.

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Alves, L.R., A.R. Ávila, A. Correa, F.B. Holetz, F.C.B. Mansur, P.A. Manque, J.P.B. de Menezes, G.A. Buck, M.A. Krieger, and S. Goldenberg. 2010. Proteomic analysis reveals the dynamic association of proteins with translated mRNAs in Trypanosoma cruzi. Gene. 452:72–78. doi:10.1016/j.gene.2009.12.009.

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Gomes, I.N., L.C. Palma, G.O. Campos, J.G.B. Lima, T.F. De Almeida, J.P.B. De Menezes, C.A.G. Ferreira, R.R. Dos Santos, G.A. Buck, P.A.M. Manque, L.S. Ozaki, C.M. Probst, L.A.R. De Freitas, M.A. Krieger, and P.S.T. Veras. 2009. The scavenger receptor MARCO is involved in Leishmania major infection by CBA/J macrophages. Parasite Immunol. 31:188–198. doi:10.1111/j.1365-3024.2009.01093.x.

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Xu, P., J.M. Alves, T. Kitten, A. Brown, Z. Chen, L.S. Ozaki, P. Manque, X. Ge, M.G. Serrano, D. Puiu, S. Hendricks, Y. Wang, M.D. Chaplin, D. Akan, S. Paik, D.L. Peterson, F.L. Macrina, and G.A. Buck. 2007. Genome of the opportunistic pathogen Streptococcus sanguinis. J. Bacteriol. 189:3166–3175. doi:10.1128/JB.01808-06.

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Xu, P., G. Widmer, Y. Wang, L.S. Ozaki, J.M. Alves, M.G. Serrano, D. Puiu, P. Manque, D. Akiyoshi, A.J. Mackey, W.R. Pearson, P.H. Dear, A.T. Bankier, D.L. Peterson, M.S. Abrahamsen, V. Kapur, S. Tzipori, and G.A. Buck. 2004. Erratum: The genome of Cryptosporidium hominis (Nature (2004) 431 (1107-1112)). Nature. 432:415. doi:10.1038/nature03141.

Xu, P., G. Widmer, Y. Wang, L.S. Ozaki, J.M. Alves, M.G. Serrano, D. Pulu, P. Manque, D. Akiyoshi, A.J. Mackey, W.R. Pearson, P.H. Dear, A.T. Bankler, D.L. Peterson, M.S. Abrahamsen, V. Kapur, S. Tzipori, and G.A. Buck. 2004. The genome of Cryptosporidium hominis. Nature. 431:1107–1112. doi:10.1038/nature02977.

Patricio-linea-de-investigacion-pic1.jpg#asset:99El laboratorio de Biología de Redes combina la biología de sistemas con la biología molecular, bioquímica, estudios celulares y animales para comprender los mecanismos de enfermedades humanas. Se aplican enfoques basados en la teoría de redes para construir redes específicas de enfermedades que permiten identificar nuevos genes, vías, subredes responsables de la patología molecular de una enfermedad. Para lograr esto, se recopilan grandes conjuntos de datos (RNAseq, CNV, HUGE, Proteomics) y combinan con un conjunto diversas herramientas bioinformáticas, por ejemplo, el análisis funcional convergente. Este enfoque permite, (i) identificar los cambios topológicos en la estructura general de la red, (ii) desentrañar nuevos genes o nuevas interacciones asociadas con una enfermedad, y (iii) detectar posibles reguladores maestros en las redes específicas de la enfermedad. Una vez que se identifica bioinformáticamente un gen candidato, se investiga su papel durante la enfermedad con un amplio conjunto de herramientas experimentales. Este enfoque actual es la caracterización de nuevos genes implicados en el “diseasosome” de la enfermedad neurodegenerativa esclerosis lateral amiotrófica (ELA).

Nombre: FONDECYT

Tìtulo: Defining the role of KIAA0226L/C13ORF18 in the autophagy/endolysosomal pathway during ALS pathology.

Institucion que financia: CONICYT

Investigador responsable: Patricio Manque

Fecha de ejecución: 2015-2019

Nombre: FONDECYT

Título: Loss of key functions drives Salmonella Typhi adaptive pathogenesis to humans.

Institución que financia: CONICYT

Fecha de ejecución: 2015-2019

Fernanda Hernandez Berrios
Asistente de Investigación

Ingeniero en Biotecnología, Universidad Andrés Bello. En el cargo de Asistente de investigación y organización del laborarorio, junto con el laboratorio de biología molecula

Cristian Bergmann
Estudiante de Doctorado

Licenciado en Tecnología Médica de la Universidad Mayor. Estudia las funciones de RUBCNL en las propiedades inmunomodulatorias de células madres mesenquimales.


RED

Nacional

Felipe Court, Centro de Biología Integrativa, Universidad Mayor, Chile

Flavio Carrión, Centro de Medicina Traslacional, Universidad del Desarrollo, Chile

Claudio Hetz, Instituto de Neurociencia Biomédica, Universidad de Chile, Chile

Internacional

Mathieu Bertrand, Inflammation Research Center, Ghent University, Ghent, Belgium

Peter Vandenabeele, Inflammation Research Center, Ghent University, Ghent, Belgium

Gregory Buck, Center for Biological Complexity, Virginia Commonwealth University, Richmond, USA