Obtuvo su doctorado en Microbiología e Inmunologia en la Universidad Federal de Sao Paulo, Brasil (UNIFESP). Posteriormente el realizó un Postdoctorado en la misma universidad y un segundo Postdoctorado en Genómica en la Virginia Commonwealth University, Estados Unidos. Posteriormente, regresó a Chile donde fundó, en la Universidad Mayor, el primer Centro de Genómica de Chile. En este centro, comenzó a aplicar abordajes de biología de sistemas para estudiar enfermedades neurodegenerativas
Matamala, J.M., R. Arias-Carrasco, C. Sanchez, M. Uhrig, L. Bargsted, S. Matus, V. Maracaja-Coutinho, S. Abarzua, B. van Zundert, R. Verdugo, P. Manque, and C. Hetz. 2018. Genome-wide circulating microRNA expression profiling reveals potential biomarkers for amyotrophic lateral sclerosis. Neurobiol. Aging. 64:123–138. doi:10.1016/j.neurobiolaging.2017.12.020.
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 | El laboratorio de Biología de Redes combina la biología de sistemas con la biología molecular, bioquímica, estudios celulares y animales para comprender los mecanismos de enfermedades humanas. Se aplican enfoques basados en la teoría de redes para construir redes específicas de enfermedades que permiten identificar nuevos genes, vías, subredes responsables de la patología molecular de una enfermedad. Para lograr esto, se recopilan grandes conjuntos de datos (RNAseq, CNV, HUGE, Proteomics) y combinan con un conjunto diversas herramientas bioinformáticas, por ejemplo, el análisis funcional convergente. Este enfoque permite, (i) identificar los cambios topológicos en la estructura general de la red, (ii) desentrañar nuevos genes o nuevas interacciones asociadas con una enfermedad, y (iii) detectar posibles reguladores maestros en las redes específicas de la enfermedad. Una vez que se identifica bioinformáticamente un gen candidato, se investiga su papel durante la enfermedad con un amplio conjunto de herramientas experimentales. Este enfoque actual es la caracterización de nuevos genes implicados en el “diseasosome” de la enfermedad neurodegenerativa esclerosis lateral amiotrófica (ELA). |
Nombre: FONDECYT
Tìtulo: Defining the role of KIAA0226L/C13ORF18 in the autophagy/endolysosomal pathway during ALS pathology.
Institucion que financia: CONICYT
Investigador responsable: Patricio Manque
Fecha de ejecución: 2015-2019
Nombre: FONDECYT
Título: Loss of key functions drives Salmonella Typhi adaptive pathogenesis to humans.
Institución que financia: CONICYT
Fecha de ejecución: 2015-2019
Fernanda Hernandez Berrios
Asistente de Investigación
Ingeniero en Biotecnología, Universidad Andrés Bello. En el cargo de Asistente de investigación y organización del laborarorio, junto con el laboratorio de biología molecula
Cristian Bergmann
Estudiante de Doctorado
Licenciado en Tecnología Médica de la Universidad Mayor. Estudia las funciones de RUBCNL en las propiedades inmunomodulatorias de células madres mesenquimales.
Nacional
Felipe Court, Centro de Biología Integrativa, Universidad Mayor, Chile
Flavio Carrión, Centro de Medicina Traslacional, Universidad del Desarrollo, Chile
Claudio Hetz, Instituto de Neurociencia Biomédica, Universidad de Chile, Chile
Internacional
Mathieu Bertrand, Inflammation Research Center, Ghent University, Ghent, Belgium
Peter Vandenabeele, Inflammation Research Center, Ghent University, Ghent, Belgium
Gregory Buck, Center for Biological Complexity, Virginia Commonwealth University, Richmond, USA
