Development of competences is highly dependent on available state-of-the-art technologies, which also increases research impact and international networking. At CIB we are implementing a research model based on open laboratories and technological platforms. This model potentiate the interdisciplinary nature of the Center.
RNA ANALYSIS
Rodrigo López
The RNA analysis unit allows the quantification of nucleic acids by means of a spectrophotometer and a fluorometer luminometer for microplates Thermo Scientific. It also allows the amplification of nucleic acids by an Eppendorf thermal cycler.
BIOCHEMISTRY
Maritza Oñate, Claudia Orellana (analytical balance)
, 
The biochemistry unit allows the realization of Western blot. It also has an analytical balance and a micro ultracentrifuge Hitachi.
ELECTROPHORESIS
Agarose electrophoresis: Rodrigo Leal. Protein electrophoresis: Maritza Oñate
,
The electrophoresis unit allows the realization of protein electrophoresis in polyacrylamide gels and nucleic acid electrophoresis in agarose gels.
CELL CULTURE
Cristian Saquel
The cell culture unit allows the realization of primary cultures and the maintenance of cell lines. The following primary cultures are performed: Schwann cells (mouse), dorsal root ganglia neurons (rat), hippocampal neurons (rat), dopaminergic neurons (mouse) and cortical neurons. The HEK cell line is available.
ANIMA MODEL: ZEBRAFISH
Leonardo Valdivia
We work with zebrafish to understand the development of the nervous system under normal conditions and genetic compromise. For this we have a room of 33 m2 with a system of stand alone tanks ZD660 Aquaneering of last generation for maintenance of lines of mutant and transgenic fish. The care of the animals is in charge of specialized personnel. Our experimental platform has microinjectors and micromanipulators to deliver intracellular volumes in the order of picoliters to microliters in fecundated eggs of zebrafish. These precision systems are coupled to binocular microscopes that allow the manipulation of embryos and description of phenotypes. Together, these modern resources allow us to perform experiments of gain and loss of gene function, and modifications of the genome of the fish.
ANIMAL MODEL: DROSOPHILA
Mario Sanhueza
The Drosophila animal model unit has wild type flies, as well as transgenic models with reporter genes and knockout models. In vivo, behavioral and survival studies are carried out, complying with basic bioethical and biosecurity norms. Study models of various human diseases are available to evaluate the modification of pathological phenotypes through genetic interactions and drug application.
ANIMAL MODEL: MOUSE
Alejandra Catenaccio
Wild mice type, models of transgenic mice with reporter genes and knockout mice are available. Studies in vivo and postmortem are carried out according to basics bioethical and biosecurity norms. A wide variety of behavioral studies are performed.
HISTOLOGY
Alejandra Catenaccio
The histology unit allows the preparation of biological samples for light, fluorescence and electronic microscopy. It allows obtaining tissue slices from plastic resin embedded tissues and frozen tissues. It also allows the visualization and obtaining of clear light images through a Nikon microscope equipped with camera.
CYTOMETRY
Paola Murgas
The CytoFLEX flow cytometer has three lasers (488 nm, 638 nm and 405 nm) and 13 fluorescence detectors. It allows reading samples in Eppendorf tubes and 96-well plates. Optimized to solve lymphocytes, monocytes and granulocytes, as well as nanoparticles. It has the CytExpert software for CytoFLEX.
HUB DE MICROSCOPÍA
Operation
The microscopy research hub provides consultation and guidance in microscopy techniques for researchers who are interested in utilizing wide-field fluorescence, confocal or lightsheet microscopy. We invite the development of collaborations, especially pertaining to the utilization of mitochondrial function imaging techniques which we are actively optimizing. Daily functions are managed by Ramon Ramirez who trains researchers on the use of equipment, maintains and trouble-shoots problems, teaches basic and advanced workshops, develops the use of new techniques and stays current with the advances in the imaging field. The academic director of the hub, Alenka Lovy, is available to meet with researchers to design microscopy projects, including those for undergraduate students. These short-term projects not only introduce students to our laboratories but also provide a certified training on specific instruments.
Directora Académica:Alenka Lovy
Coordinador: Ramon Ramirez
Equipos y recursos disponibles
El microscopio de hoja de luz Zeiss 7 integra un sistema de imágenes autónomo con: 1) Un sistema capilar que permite introducir muestras completas; 2) sistema de incubación con control de temperatura; 3) láseres de 488, 561 y 638 nm; 4) Óptica de iluminación dual; 5) óptica de detección, incluidos objetivos 5X y 20X optimizados para organismos completos y técnicas como CLARITY y EXPANSION 6) cámaras PCO Edge sCMOS duales de alta resolución. Es importante destacar que el control de temperatura facilita el análisis in vivo en este microscopio. La expresión de transgenes fluorescentes en Drosophila, peces, larvas y embriones adultos, en el nematodo C. elegans, en embriones de Tribolium y en raíces de Arabidopsis, se puede explotar fácilmente para experimentos in vivo en este LSFM de Zeiss, así como en muestras de gran volumen, como cerebros completos clarificados y otros órganos o tejidos animales.
El microscopio confocal Leica TCS SP8 con detector espectral y el sistema AOBS (divisor de haz acústico-óptico) tiene cuatro láseres de 405 nm, Argón, 561 nm y 647 nm, y ocho líneas de excitación. Permite la visualización de fluorescencia en muestras biológicas fijadas y también en células vivas en cultivo. Entre las técnicas que se pueden realizar se encuentran FRET y FRAP. También permite la visualización de luz transmitida con contraste de fase, polarización y óptica DIC (Nomarski). Permite obtener series en el eje Z para reconstrucciones 3D. Además, contamos con el soporte necesario para realizar experimentos in vivo (cámara termorregulada, control de CO2).
Este microscopio se complementa con una platina motorizada que permite navegar la muestra en base a coordenadas definidas por los usuarios y automatizar la toma de imágenes de grandes áreas con la mayor resolución posible. Incluye los siguientes cubos para visualizar los fluoróforos clásicos: DAPI (EX: 325-375, EM: 435-485); GFP (EX: 450-490, EM: 500-550), rojo Texas (EX: 540-580, EM: 592-668), Cy5 (EX: 590-650, EM: 662-738). Se encuentra disponible una incubadora que permite el control de CO2 y temperatura para realizar ensayos de imágenes de células vivas.
El Hub de Microscopía brinda acceso a un software especializado en análisis de imágenes, llamado IMARIS que permite a los laboratorios tener una visualización interactiva, y la realización de animaciones 3D y 4D, detectar estructuras 3D para medidas, conteo, intensidad, tamaño, forma y distancia, clasificar objetos en clases definidas por el usuario, incluso aprendizaje automático minucioso, colocalización basada en intensidad (Mander's, Pearson,% de superposición, etc.) y rastreo de datos en 1D-4D, comparando clases y grupos con pruebas estadísticas. ImageJ es un software gratuito que también puede responder a muchas preguntas en el análisis de imágenes. Imaris puede reservarse para trabajo independiente o los usuarios pueden ser asistidos parcialmente por el profesional a cargo. El análisis de imágenes permite a los investigadores obtener datos cuantitativos (números, áreas, duración en el tiempo, etc.) y cualitativos (forma, textura, etc.) a partir de imágenes microscópicas.