Ute Woehlbier

Director de Centro y Profesor Asociado


Obtuvo en 2003 un Dipl. Biol./M.Sc. En biología molecular y en 2007 un Dr. rer. nat./Ph.D. Ambos de la Universidad de Heidelberg, Alemania. Durante su maestría y doctorado, tanto estudió la estructura macromolecular y la inmunogenicidad de las proteínas de la superficie del parásito de la malaria Plasmodium falciparum con el objetivo de contribuir al desarrollo de la vacuna contra la malaria. Entre 2007 y 2010, realizó un postdoctorado en el Centro de Complejidad Biologica en la Virginia Commonwealth University, EE. UU., estudiando el potencial de la vacuna de las proteínas del parásito intestinal Cryptosporidium sp. identificado por un enfoque de vacunología inversa utilizando la secuencia del genoma y la bioinformática. Entre 2010-2013 realizó un segundo Postdoc en la Universidad de Chile, Chile, en neurociencia, estudiando el papel de las mutaciones en las proteínas disulfuro isomerasas identificadas en pacientes con esclerosis lateral amiotrófica (ELA). En octubre de 2013, estableció su laboratorio en la Universidad Mayor caracterizando nuevas proteínas en la enfermedad. Actualmente su equipo esta enfocando en estudiar nuevas proteínas involucradas en la ELA identificadas por un enfoque bioinformático basado en la red. Utiliza un amplio espectro de técnicas, como bioinformática, biología molecular, bioquímica, biología celular, así como sistemas de modelos in vivo para comprender el papel de estas en la mayoría de los casos de proteínas no caracterizadas o no estudiadas en la enfermedad.


Ute Woehlbier

PUBLICACIONES

2015-pres

Oyarce-Pezoa S, Rucatti GG, Muñoz-Carvajal F, Sanhueza N, Gomez W, Espinoza S, Leiva M, García N, Ponce DP, SanMartín CD, Rojas-Rivera D, Salvadores N, Behrens MI, Woehlbier U, Calegaro-Nassif M, Sanhueza M. The autophagy protein Def8 is altered in Alzheimer's disease and Aβ42-expressing Drosophila brains. Sci Rep. 2023 Oct 10;13(1):17137. doi: 10.1038/s41598-023-44203-6.

Sanhueza SA, Vidal MA, Hernández MA, Henriquez-Beltran ME, Cabrera CD, Quiroga RA, Antilef BE, Aguilar KP, Castillo DA, Llerena FJ, Fraga MA, Nazal M, Castro E, Lagos P, Moreno A, Lastra JJ, Gajardo J, Garces P, Riffo B, Buchert J, Sanhueza R, Ormazabal VA, Saldivia P, Vargas C, Nourdin G, Koch E, Zúniga FE, Lamperti LI, Bustos P, Guzman-Gutiérrez E, Aguayo C, Ferrada L, Cerda F, Woehlbier U, Riquelme E, Yuseff MI, Muñoz B, Lombardi G, de Gonzalo-Calvo D, Salomon C, Verdugo RA, Quiñones L, Colombo A, Labarca G, Nova-Lamperti E. Cardiac dysfunction mediators supports long-term pulmonary dysfunction in Long-COVID19 patients. Front Med (Lausanne). 2023 Oct 6;10:1271863. doi: 10.3389/fmed.2023.1271863. eCollection 2023.

Bergmann CA, Beltran S, Vega-Letter AM, Murgas P, Hernandez MF, Gomez L, Labrador L, Cortés BI, Poblete C, Quijada C, Carrion F, Woehlbier U*, Manque PA*. (2022) The Autophagy Protein Pacer Positively Regulates the Therapeutic Potential of Mesenchymal Stem Cells in a Mouse Model of DSS-Induced Colitis. Cells. 2022 Apr 30;11(9):1503. (*equal contribution)

Espinoza S, Grunenwald F, Gomez W, García F, Abarzúa-Catalan L, Oyarce-Pezoa S, Hernandez MF, Cortés BI, Uhrig M, Ponce DP, Durán-Aniotz C, Hetz C, SanMartín CD, Cornejo VH, Ezquer F, Parra V, Behrens MI, Manque PA, Rojas-Rivera D, Vidal RL, Woehlbier U, Nassif M. (2022) Neuronal Rubicon Represses Extracellular APP/Amyloid β Deposition in Alzheimer's Disease. Cells. 2022 Jun 7;11(12):1860.

Medinas D, Malik S, Yıldız-Bölükbaşı E, Borgonovo J, Saaranen MJ, Urra H, Pulgar E, Afzal M, Contreras D, Wright MT, Bodaleo F, Quiroz G, Rozas P, Mumtaz S, Díaz R, Rozas C, Cabral-Miranda F, Piña R, Valenzuela V, Uyan O, Reardon C, Woehlbier U, Brown RH, Sena-Esteves M, Gonzalez-Billault C, Morales B, Plate L, Ruddock LW, Concha ML, Hetz C, Tolun A. Mutation in protein disulfide isomerase A3 causes
neurodevelopmental defects by disturbing endoplasmic reticulum proteostasis. EMBO J. 2022 Jan 17;41(2):e105531.

Leyton E, Matus D, Espinoza S, Benitez JM, Cortés BI, Gomez W, Arévalo NB, Murgas P, Manque P, Woehlbier U, Duran-Aniotz C, Hetz C, Behrens MI, SanMartín CD, Nassif M. DEF8 and Autophagy-Associated Genes Are Altered in Mild Cognitive Impairment, Probable Alzheimer's Disease Patients, and a Transgenic Model of the Disease. J Alzheimers Dis. 2021;82(s1):S163-S178

Beltran S., M. Nassif, E. Vicencio, J. Arcos, L. Labrador, B.I. Cortes, C. Cortez, C.A. Bergmann, S. Espinoza, M.F. Hernandez, J.M. Matamala, L. Bargsted, S. Matus, D. Rojas-Rivera, M.J.M. Bertrand, D.B. Medinas, C. Hetz, P.A. Manque, U. Woehlbier. 2019. Network approach identifies Pacer as an autophagy protein involved in ALS pathogenesis. Mol Neurodegener. 2019 Mar 27;14(1):14. doi: 10.1186/s13024-019-0313-9.

Medinas, D.B., P. Rozas, F. Martínez Traub, U. Woehlbier, R.H. Brown, D.A. Bosco, and C. Hetz. 2018. Endoplasmic reticulum stress leads to accumulation of wild-type SOD1 aggregates associated with sporadic amyotrophic lateral sclerosis. Proc Natl Acad Sci U S A. 115. doi: 10.1073/pnas.1801109115.

Yıldırım, Y., T. Ouriachi, U. Woehlbier, W. Ouahioune, M. Balkan, S. Malik, and A. Tolun. 2018. Linked homozygous BMPR1B and PDHA2 variants in a consanguineous family with complex digit malformation and male infertility. Eur. J. Hum. Genet. 26. doi:10.1038/s41431-018-0121-7.

Yildiz Bölükbasi, L.E., S. Mumtaz, M. Afzal, U. Woehlbier, S. Malik, and A. Tolun. 2018. Homozygous mutation in CEP19, a gene mutated in morbid obesity, in Bardet-Biedl syndrome with predominant postaxial polydactyly. J. Med. Genet. 55. doi:10.1136/jmedgenet-2017-104758.

Nassif, M., U. Woehlbier, and P.A. Manque. 2018. The Delicate Balance of Autophagy in Neurodegeneration, Autophagy: Cancer, Other Pathologies, Inflammation, Immunity, Infection, and Aging, Pages 387-399.

Nassif, M., U. Woehlbier, and P.A. Manque. 2017. The Enigmatic Role of C9ORF72 in Autophagy, Front Neurosci. 11. doi:10.3389/fnins.2017.00442.

Woehlbier, U., A. Colombo, M.J. Saaranen, V. Pérez, J. Ojeda, F.J. Bustos, C.I. Andreu, M. Torres, V. Valenzuela, D.B. Medinas, P. Rozas, R.L. Vidal, R. Lopez-Gonzalez, J. Salameh, S. Fernandez-Collemann, N. Muñoz, S. Matus, R. Armisen, A. Sagredo, K. Palma, T. Irrazabal, S. Almeida, P. Gonzalez-Perez, M. Campero, F.-B. Gao, P. Henny, B. Van Zundert, L.W. Ruddock, M.L. Concha, J.P. Henriquez, R.H. Brown, and C. Hetz. 2016. ALS-linked protein disulfide isomerase variants cause motor dysfunction. EMBO J. 35. doi:10.15252/embj.201592224.

Castillo, V., M. Oñate, U. Woehlbier, P. Rozas, C. Andreu, D. Medinas, P. Valdés, F. Osorio, G. Mercado, R.L. Vidal, B. Kerr, F.A. Court, and C. Hetz. 2015. Functional role of the disulfide isomerase ERp57 in axonal regeneration. PLoS One. 10. doi:10.1371/journal.pone.0136620.

Torres, M., D.B. Medinas, J.M. Matamala, U. Woehlbier, V.H. Cornejo, T. Solda, C. Andreu, P. Rozas, S. Matus, N. Muñoz, C. Vergara, L. Cartier, C. Soto, M. Molinari, and C. Hetz. 2015. The protein-disulfide isomerase ERp57 regulates the steady-state levels of the prion protein. J. Biol. Chem. 290. doi:10.1074/jbc.M114.635565.

Gonzalez-Perez, P., U. Woehlbier, R.-J. Chian, P. Sapp, G.A. Rouleau, C.S. Leblond, H. Daoud, P.A. Dion, J.E. Landers, C. Hetz, and R.H. Brown. 2015. Identification of rare protein disulfide isomerase gene variants in amyotrophic lateral sclerosis patients. Gene. 566. doi:10.1016/j.gene.2015.04.035.


LíNEAS DE INVESTIGACIÓN

Identificación bioinformática y caracterización de nuevas proteínas implicadas en la enfermedad

Junto con el laboratorio del Dr. Patricio Manque, nuestro laboratorio combina biología de sistemas con biología molecular, bioquímica, estudios celulares y animales para comprender los mecanismos de las enfermedades humanas. Aplicamos enfoques basados ​​en redes para construir redes específicas de enfermedades que nos permiten identificar nuevos genes, vías y subredes responsables de la patología molecular de una enfermedad. Para lograr esto, recopilamos grandes conjuntos de datos (RNAseq, CNV, HUGE, Proteomics) y los combinamos con un conjunto diverso de herramientas bioinformáticas, p. Ej. Análisis convergente. Este enfoque nos permite, (i) identificar cambios topológicos en la estructura general de la red, (ii) desentrañar nuevos genes o nuevas interacciones asociadas con una enfermedad, y (iii) detectar potenciales reguladores maestros en las redes específicas de la enfermedad. Una vez que identificamos bioinformáticamente un gen candidato, investigamos su papel durante la enfermedad con un amplio conjunto de herramientas experimentales. Actualmente nos estamos centrando en la caracterización de nuevos genes insertados en el trastorno de la enfermedad neurodegenerativa esclerosis lateral amiotrófica (ELA).

El papel de la nueva autofagia de la proteína Pacer en la patología de la ELA.

Un enfoque basado en una red bioinformática sugirió que la proteína Pacer, previamente no caracterizada, desempeñe un papel en la patología de ELA a través de su función en la autofagia. Usando modelos celulares y de ratón de ALS, ahora estamos investigando el papel de Pacer durante la enfermedad y si su pérdida o ganancia de función tiene algún efecto sobre los mecanismos moleculares de la neurodegeneración.

Mecanismos celulares del potencial inmune modulador de las células madre mesenquimales.

Las células madre mesenquimales ofrecen un enfoque de terapia celular importante y ampliamente utilizado para diferentes enfermedades, p. Ej. síndrome inflamatorio intestinal, enfermedad de Crohn, así como enfermedades del sistema nervioso, como la ELA. Se ha sugerido que la autofagia está involucrada en el potencial inmune modulador de las células madre mesenquimales (MSC), que ahora se utilizan ampliamente como un enfoque de terapia celular. Por lo tanto, junto con el laboratorio del Dr. Manque, investigamos si la nueva autofagia de la proteína Pacer cumple una función reguladora hacia esta propiedad de las MSC

PROYECTOS

Activo

2024-2028 FONDECYT Regular 1240176 (Investigador Principal)

Terminado

2020-2024 FONDECYT Regular 1200459 (Investigador Principal)

2019-2020 FONDO Puente PEP I-2019054 (Investigador Principal)

2015-2019 FONDECYT Regular 1150743 (Investigador Principal)

2010-2013 Fondecyt Postdoc 3110067 (Investigador Principal)

EQUIPO

Giselle Espinosa Estudiante de Doctorado en Genomica Integrativa, Universidad Mayor.

Carla Alarcon Estudiante de Doctorado en Neurobiologia, Universidad Mayor.

Leonardo Rodriguez Estudiante de Doctorado en Genomica Integrativa, Universidad Mayor.


Miembros de laboratorio anteriores

Sebastian Beltran Estudiante de Doctorado en Genomica Integrativa y Investigador Postdoctoral, ahora Director de la Escuela de Tecnologia Medica de la Universidad Mayor, Chile

Luis Labrador Estudiante de Doctorado en Genomica Integrativa, ahora Investigador Postdoctoral en Cincinnati Children's Hospital, EEUU

Emiliano Vicencio Estudiante de Doctorado en Genomica Integrativa, ahora Investigador Postdoctoral en la Universidad de Chile, Chile

RED

Nacional

Mauricio Hernandez, Melisa Institute, Concepcion, Chile

Estefania Nova-Lamberti, Universidad de Concepcion, Chile

Diego Rojas-Rivera, Center for Biomedicine, Universidad Mayor, Chile

Melissa Nassif, Center for Biomedicine, Universidad Mayor, Chile

Rene Vidal, Center for Integrative Biology, Universidad Mayor, Chile

Francisca Cornejo, Center for Integrative Biology, Universidad Mayor, Chile

Felipe Court, Center for Integrative Biology, Universidad Mayor, Chile

Cesar Cardenas, Center for Integrative Biology, Universidad Mayor, Chile

Internacional

Danilo Medinas, Universidad Sao Paolo, Brasil

Mathieu Bertrand, Inflammation Research Center, Ghent University, Belgium