Profesor Titular
Obtuvo su doctorado en Microbiología e Inmunologia en la Universidad Federal de Sao Paulo, Brasil (UNIFESP). Posteriormente el realizó un Postdoctorado en la misma universidad y un segundo Postdoctorado en Genómica en la Virginia Commonwealth University, Estados Unidos. Posteriormente, regresó a Chile donde fundó, en la Universidad Mayor, el primer Centro de Genómica de Chile. En este centro, comenzó a aplicar abordajes de biología de sistemas para estudiar enfermedades neurodegenerativas. En el Centro de Biologia Integrativa (CIB) el utiliza teoria de redes para identificar nuevos blancos terapéuticas en enfermedades neurodegenerativas y cancer.
PUBLICACIONES
2015-pres
LíNEAS DE INVESTIGACIÓN
El laboratorio de Biología de Redes combina la biología de sistemas con la biología molecular, bioquímica, estudios celulares y animales para comprender los mecanismos de enfermedades humanas. Se aplican enfoques basados en la teoría de redes para construir redes específicas de enfermedades que permiten identificar nuevos genes, vías, subredes responsables de la patología molecular de una enfermedad. Para lograr esto, se recopilan grandes conjuntos de datos (RNAseq, CNV, HUGE, Proteomics) y combinan con un conjunto diversas herramientas bioinformáticas, por ejemplo, el análisis funcional convergente. Este enfoque permite, (i) identificar los cambios topológicos en la estructura general de la red, (ii) desentrañar nuevos genes o nuevas interacciones asociadas con una enfermedad, y (iii) detectar posibles reguladores maestros en las redes específicas de la enfermedad. Una vez que se identifica bioinformáticamente un gen candidato, se investiga su papel durante la enfermedad con un amplio conjunto de herramientas experimentales. Este enfoque actual es la caracterización de nuevos genes implicados en el “diseasosome” de la enfermedad neurodegenerativa esclerosis lateral amiotrófica (ELA).
PROYECTOS
Activo
2021-2025 FONDECYT Regular 1210507 (Co-Investigador)
Terminados
2015-2019 FONDECYT Regular 1150743 (Co-Investigador)
2015-2019 FONDECYT Regular 1151393 (Co-Investigador)
2014-2017 USA/Chile grant USA-2013-0041 (Investigador responsable)
2012-2016 FONDECYT Regular 1131038 (Co-Investigador)
2012-2015 Anillo ACT1109 (Investigador responsable)
EQUIPO
Fernanda Hernandez Berrios
Asistente de Investigación
Ingeniero en Biotecnología, Universidad Andrés Bello. En el cargo de Asistente de investigación y organización del laborarorio, junto con el laboratorio de biología molecula
Cristian Bergmann
Estudiante de Doctorado
Licenciado en Tecnología Médica de la Universidad Mayor. Estudia las funciones de RUBCNL en las propiedades inmunomodulatorias de células madres mesenquimales.
RED
Nacional
Felipe Court, Centro de Biología Integrativa, Universidad Mayor, Chile
Marcelo Garrido, Centro de Oncologia Precision, Universidad Mayor, Chile
Ignacio Retamal, Centro de Oncologia Precision, Universidad Mayor, Chile
Internacional
Mathieu Bertrand, Inflammation Research Center, Ghent University, Ghent, Belgium
Gregory Buck, Center for Biological Complexity, Virginia Commonwealth University, Richmond, USA